Cours

Calendrier

Les diapos et les notes sont uniquement en anglais

Date	Sujet	Lecture

9 janv.	Introduction	Smaldino et McElreath (2016)
16 janv.	Introduction à Quarto	Alston et Rick (2021)
23 janv.	Introduction à Github	Ivimey-Cook et al. (2023)
30 janv.	Modèles linéaires généralisés (et révisions modèles linéaires)	Zuur et al. (2010)
6 févr.	Structure causale et construction de modèle	Cinelli et al. (2022), Wysocki et al. (2022)
13 févr.	Introduction aux modèles mixtes	Harrison et al. (2018)
Semaine de Lecture
27 févr.	Intro analyse Bayesienne	Kruschke et Liddell (2018)
5 mars	Modèles mixtes généralisés	Bolker et al. (2009)
12 mars	Discussion sur les plans pour les projets écrits	Wasserstein et Lazar (2016)
19 mars	Modèles mixtes multivariés	Van de Pol et Wright (2009)
26 mars		Schielzeth et Forstmeier (2009)
2 avr.		Forstmeier et al. (2017)

À propos des diapos et des notes

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Les références

Alston, J. M., et J. A. Rick. 2021. A Beginner’s Guide to Conducting Reproducible Research. The Bulletin of the Ecological Society of America 102:e01801.

Bolker, B. M., M. E. Brooks, C. J. Clark, S. W. Geange, J. R. Poulsen, M. H. H. Stevens, et J.-S. S. White. 2009. Generalized Linear Mixed Models: A Practical Guide for Ecology and Evolution. Trends in Ecology and Evolution 24:127‑135.

Cinelli, C., A. Forney, et J. Pearl. 2022. A Crash Course in Good and Bad Controls. Sociological Methods & Research:00491241221099552.

Forstmeier, W., E.-J. Wagenmakers, et T. H. Parker. 2017. Detecting and Avoiding Likely False-Positive Findings – a Practical Guide. Biological Reviews 92:1941‑1968.

Harrison, X. A., L. Donaldson, M. E. Correa-Cano, J. Evans, D. N. Fisher, C. E. D. Goodwin, B. S. Robinson, D. J. Hodgson, et R. Inger. 2018. A Brief Introduction to Mixed Effects Modelling and Multi-Model Inference in Ecology. PeerJ 6:e4794.

Ivimey-Cook, E. R., J. L. Pick, K. R. Bairos-Novak, A. Culina, E. Gould, M. Grainger, B. M. Marshall, D. Moreau, M. Paquet, R. Royauté, A. Sánchez-Tójar, I. Silva, et S. M. Windecker. 2023. Implementing Code Review in the Scientific Workflow: Insights from Ecology and Evolutionary Biology. Journal of Evolutionary Biology 36:1347‑1356.

Kruschke, J. K., et T. M. Liddell. 2018. Bayesian Data Analysis for Newcomers. Psychonomic Bulletin & Review 25:155‑177.

Schielzeth, H., et W. Forstmeier. 2009. Conclusions beyond Support: Overconfident Estimates in Mixed Models. Behavioral Ecology 20:416‑420.

Smaldino, P. E., et R. McElreath. 2016. The Natural Selection of Bad Science. Royal Society Open Science 3:160384.

Van de Pol, M., et J. Wright. 2009. A Simple Method for Distinguishing Within-versus between-Subject Effects Using Mixed Models. Animal behaviour 77:753‑758.

Wasserstein, R. L., et N. A. Lazar. 2016. The ASA Statement on P-Values: Context, Process, and Purpose. The American Statistician 70:129‑133.

Wysocki, A. C., K. M. Lawson, et M. Rhemtulla. 2022. Statistical Control Requires Causal Justification. Advances in Methods and Practices in Psychological Science 5:25152459221095823.

Zuur, A. F., E. N. Ieno, et C. S. Elphick. 2010. A Protocol for Data Exploration to Avoid Common Statistical Problems. Methods in Ecology and Evolution 1:3‑14.